基层卫生部门官员表示，农村厕改推动了农民传统卫生习惯的改变，有助于带动普通农民更新卫生观念。随着改厕健康教育和卫生常识不断深入，越来越多的农民逐渐接受了饭前便后洗手、不喝生水、不吃生食等卫生习惯。
农村厕改等工程让他们的生活环境发生了巨大变化。如今家里有卫生厕所，村子有了专人保洁，还有车辆清运、垃圾也有地方填埋。“越来越多人养成了爱护环境卫生的好习惯”。
中国疾病预防控制中心农村改水技术指导中心研究员付彦芬指出，农村厕所问题不仅仅是气味难闻，更重要的是卫生隐患大。
付彦芬说，人畜共患病的问题在农村地区十分常见。此外，农村地区80%的传染病是由厕所粪便污染和饮水不卫生引起，其中与粪便有关的传染病达30余种，常见的有痢疾、霍乱、肝炎、感染性腹泻等。
农村厕改使得农民肠道等传染病发病率逐年下降。例如，山西南部绛县推广无害化卫生厕所之后，已经帮助6万多农民告别蚊蝇滋生的老式旱厕，当地肠道传染病减少46%、蛔虫病减少40%，蝇虫密度降低90%以上。
中国卫生部门官员表示，中国农村厕改工作是改善环境、防治疾病的治本之策，有力促进了农村生态文明建设，推动了民众文明卫生素质的提高，保障了民众的健康。
2015年7月17日，国家旅游局组织召开的大型企业投身投身厕所革命表彰会在京举行。对积极参与厕所革命、主动捐助建设厕所的全联旅游业商会获得“厕所革命突出贡献商会奖”；鄂旅投、北京首旅集团、中青旅、江泰保险等企业获得“厕所革命突出贡献企业奖”。
2017年11月，习近平总书记就旅游系统推进“厕所革命”工作取得的成效作出重要指示。广大干部群众反响热烈，大家认为，倡导推进“厕所革命”，体现了习近平总书记对百姓民生、城乡文明的高度关切，彰显了从小处着眼、从实处入手的务实作风，为新时代推动旅游业大发展、实施乡村振兴战略注入了强大动力。
